Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms