Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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