Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms