Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms