Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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