Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NME3Q13232 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NME3Q13232 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NME3Q13232 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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