Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFFO1Q0D2I5 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms