Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms