Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL450023.2-201ENST00000453276 545 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL231P-201ENST00000461840 272 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PLA2G12AP1-201ENST00000497678 568 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008591.1-202ENST00000515569 462 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP001372.1-202ENST00000533008 344 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR4274-201ENST00000579577 91 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC107990.1-201ENST00000590415 489 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRMT112P7-201ENST00000603133 367 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL022329.3-201ENST00000624255 352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL355483.1-201ENST00000450469 237 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms