Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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