Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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