Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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