Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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