Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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