Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SEMA3BQ13214 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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