Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNPHO15079 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNPHO15079 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms