Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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