Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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