Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PUM3Q15397 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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PUM3Q15397 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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