Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms