Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms