Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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