Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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