| FOXE3 | Q13461 | MOSPD2-201 | ENST00000380492 | 4163 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IQCH-202 | ENST00000358767 | 3062 nt | TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLCO1A2-212 | ENST00000458504 | 2008 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IGSF10-201 | ENST00000282466 | 11067 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PEX26-201 | ENST00000329627 | 18445 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAPGEF4-215 | ENST00000540783 | 3974 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACSL5-204 | ENST00000393081 | 3380 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KLHL13-206 | ENST00000469946 | 2353 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BCL2L14-213 | ENST00000589718 | 1850 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EFCAB5-201 | ENST00000394835 | 5132 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL583808.2-201 | ENST00000418078 | 1382 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HSPA8P14-201 | ENST00000552265 | 1805 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MBNL2-204 | ENST00000397601 | 4487 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C1orf140-202 | ENST00000439004 | 4340 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | WFDC11-202 | ENST00000356562 | 642 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-289P-201 | ENST00000364093 | 107 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNA5SP500-201 | ENST00000364486 | 119 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADIG-201 | ENST00000373348 | 430 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PAGE2-202 | ENST00000374968 | 551 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIR506-201 | ENST00000384998 | 124 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-1158P-201 | ENST00000391167 | 107 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KRTAP29-1-201 | ENST00000391353 | 1026 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL031985.1-201 | ENST00000392713 | 418 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL356967.1-201 | ENST00000406305 | 431 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RNU2-62P-201 | ENST00000410868 | 191 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL355339.1-202 | ENST00000417542 | 458 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RPL34P3-201 | ENST00000421454 | 338 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTCYBP8-201 | ENST00000422855 | 651 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPL23AP4-201 | ENST00000427757 | 463 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTND6P12-201 | ENST00000428247 | 522 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL355339.1-201 | ENST00000434386 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UBE2L5P-201 | ENST00000436446 | 465 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IFNA20P-201 | ENST00000436840 | 528 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL353804.1-201 | ENST00000444482 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC01880-201 | ENST00000446593 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPS27AP15-201 | ENST00000447672 | 466 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.639-201 | ENST00000458981 | 102 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPS17P15-201 | ENST00000475609 | 349 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PPIAP19-201 | ENST00000486414 | 492 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC013356.1-201 | ENST00000489027 | 564 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRBV5-2-201 | ENST00000489095 | 273 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | JCHAIN-204 | ENST00000510437 | 640 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC063979.2-201 | ENST00000513767 | 958 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC062004.1-202 | ENST00000524014 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC087241.2-201 | ENST00000535801 | 324 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR52E8-201 | ENST00000537935 | 1061 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC02384-208 | ENST00000546086 | 565 nt | TSL 3 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC126178.1-201 | ENST00000548722 | 926 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC009803.2-201 | ENST00000550378 | 665 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC02277-201 | ENST00000553386 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL163195.3-202 | ENST00000555283 | 578 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00519-201 | ENST00000557518 | 682 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC066612.1-202 | ENST00000561094 | 518 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC002398.1-201 | ENST00000589397 | 427 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC104237.2-201 | ENST00000612456 | 443 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC127024.6-201 | ENST00000621598 | 424 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL078596.1-201 | ENST00000624856 | 447 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIR325HG-202 | ENST00000626832 | 598 nt | TSL 4 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00506-201 | ENST00000628435 | 525 nt | TSL 4 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC01923-203 | ENST00000456248 | 2528 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CSNK1G1-204 | ENST00000606793 | 1658 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR13C1P-202 | ENST00000641378 | 2919 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | N4BP2L2-204 | ENST00000399396 | 2872 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADGB-205 | ENST00000397944 | 5325 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAMTS9-AS1-203 | ENST00000471990 | 1606 nt | TSL 2 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DTNA-231 | ENST00000598774 | 2418 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CHMP1B2P-202 | ENST00000614414 | 6813 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ESRRG-205 | ENST00000366937 | 5365 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CCR2-201 | ENST00000292301 | 2671 nt | TSL 5 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPL7-204 | ENST00000396467 | 1526 nt | TSL 3 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AGTR1-205 | ENST00000461609 | 1545 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | XPNPEP3-201 | ENST00000357137 | 7988 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RBMY1F-201 | ENST00000303766 | 1887 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OSBPL9P1-201 | ENST00000604744 | 1469 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAPK10-328 | ENST00000641553 | 4009 nt | BASIC | 4.56 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HERC4-205 | ENST00000412272 | 4211 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CAV1-205 | ENST00000405348 | 2443 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NUDCD1-202 | ENST00000427660 | 2098 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CLIP1-AS1-201 | ENST00000535976 | 1745 nt | TSL 3 BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC025034.1-201 | ENST00000552778 | 1711 nt | TSL 3 BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF260-204 | ENST00000592282 | 5055 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACTR3BP2-202 | ENST00000623630 | 1338 nt | BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR11H5P-202 | ENST00000641612 | 1325 nt | BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRPC4-203 | ENST00000358477 | 2955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.55 | □□□□□ -1.68 | | |