Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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