Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRGP23470 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms