Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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