Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms