Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms