Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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CCDC93Q567U6 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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CCDC93Q567U6 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC93Q567U6 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC93Q567U6 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC93Q567U6 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC93Q567U6 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC93Q567U6 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC93Q567U6 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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