Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VPS72Q15906 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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