Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PTCH1Q13635 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PTCH1Q13635 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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