Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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