Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PRPF4BQ13523 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms