Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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TCIRG1Q13488 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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