Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SP140Q13342 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SP140Q13342 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP140Q13342 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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