Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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