Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms