Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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