Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms