Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms