Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms