Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms