Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms