Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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