Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRMP28827 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms