Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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