Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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