Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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