Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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