Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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